Simulando la dinámica de transmisión de pacientes coinfectados con la Covid-19 y dengue / Simulating the transmission dynamics of patients coinfected with Covid-19 and Dengue

Recientemente se han detectado pacientes infectados por la Covid-19 y con dengue en Tailandia y Singapur al mismo tiempo (coinfectados), y por tanto, se deben comenzar a diseñar medidas preventivas para el monitoreo de estos casos especiales en Latinoamérica. A raíz de ello, se presenta un modelo matemático que permite analizar este tipo de coinfección en la población humana. Finalmente, se resuelve analítica y numéricamente el modelo(AU)

Patients infected with Covid-19 and with Dengue have been detected in Thailand and Singapore at the same time (coinfected), it is necessary to monitor these cases in Latin America. For that reason we present a mathematical model that allows analyzing this type of coinfection in the human population. Finally, the model is analytically and numerically resolved according to a possible scenario in a given country(AU)

La dinámica de transmisión del Covid-19 desde una perspectiva matemática / The Transmission Dynamics of Covid-19 from a MathematicalPerspective

El presente trabajo plantea un modelo matemático capaz de reproducir la dinámica de transmisión del nuevo coronavirus (Covid-19) en grupos humanos a partir de un sistema de ecuaciones diferenciales. Para ello se dividió a la población en tres clases diferentes dependiendo de los estadios de la enfermedad: aquellos que son susceptibles de contraer el virus, los infectados y los recuperados. Los parámetros fueron determinados por mínimos cuadrados a partir de los registros diarios del Covid-19 realizados por la Universidad Johns Hopkins, y se validó en cuatro países seleccionados al azar: China, Estados Unidos, Brasil y Venezuela. Simultáneamente, se exploró la calidad de los datos para detectar cualquier manipulación o alteración de las cifras de contagios en estos cuatro países, a partir de dos metodologías computacionales empleadas en análisis forense de información digital. Así, será posible predecir grosso modo el número de contagios en el tiempo: a modo de ejemplo, se estimó que pudieran darse 597 casos de contagios en la República Bolivariana de Venezuela hasta el 22 de junio del presente año en función de la información analizada hasta el 20 de abril, fuertemente influenciada por los brotes detectados(AU)

The present work proposes a Mathematical model capable of reproducing the transmission dynamics of the new coronavirus (Covid-19) in human groups, from a system of differential equations. The total population was divided into three different types: susceptible, infected, and recovered. Parameters were developed using the least squared method, based on Johns Hopkins' Covid-19 data, and were validated in four countries: China, the United States, Brazil and Venezuela. Simultaneously, the quality of the data was explored to detect any manipulation or alteration of the numbers of infections in these four countries, based on two computational methodologies used in forensic analysis of digital information. Finally, it will be possible to estimate that 597 cases of infection could occur in the Bolivarian Republic of Venezuela, until June 22 of this year, based on the information analyzed up to April 20, heavily influenced by the detected break out(AU)

Mapeo computacional de epítopos de células B presentes en el virus del dengue / B-cell epitopes mapping of dengue virus

Dengue es una infección viral de importancia en salud pública. El desarrollo de una vacuna va a depender del conocimiento de aquello epítopos que neutralicen la infección y por ello, se generaron e identificaron computacionalmente aquellos epítopos lineales consenso de células B presentes en el virus del dengue, a partir de los datos depositados en la base de datos Immune Epitope Database (IEDB). Posteriormente, se agruparon en bloques de ocho aminoácidos por cada serotipo mediante el programa Nomad, y cada uno de ellos fue reevaluado con el programa BepiPred para determinar su antigenicidad. Se lograron postular 172 de los 1.239 obtenidos en la IEDB.

Dengue virus has emerged as a major public health problem. An epitope-based approach to the development of vaccines, and for this reason, based on Immune Epitope Database database (IEDB), linear consensus B-cell epitopes were computationally generated and identified from dengue virus. Then, amino acids were grouped into blocks of eight amino acids per serotype through Nomad program. Each block was evaluated using BepiPred for determining antigenic prediction. 172 out of 1239 were obtained from IEDB.

Identificación de nuevos medicamentos a través de métodos computacionales / Identification of new drugs through computational methods

El desarrollo de nuevos medicamentos es un problema complejo que carece de una solución única y automática desde un punto de vista computacional, debido a la carencia de programas que permitan manejar grandes volúmenes de información que están distribuidos a lo largo de todo el mundo entre múltiples bases de datos. Por ello se describe una metodología que permita realizar experimentos in silico para la identificación actual de nuevos medicamentos.

The development of new drugs is a problem that nowadays has no solution in terms of computational power due to the lack of software for handling the big volume of available information; besides, these data are stored in multiple formats and are distributed all around the world. To resolve that, a development of an in silico drug design methodology.

Assessing protein stability of the dimeric DNA-binding domain of E2 human papillomavirus 18 with molecular dynamics

The objective of this study is to understand the structural flexibility and curvature of the E2 protein of human papillomavirus type 18 using molecular dynamics (6 ns). E2 is required for viral DNA replication and its disruption could be an anti-viral strategy. E2 is a dimer, with each monomer folding into a stable open-faced â-sandwich. We calculated the mobility of the E2 dimer and found that it was asymmetric. These different mobilities of E2 monomers suggest that drugs or vaccines could be targeted to the interface between the two monomers.